Theo Thông tư số 11/2016/TT-BYT ngày 11/05/2016 của Bộ Y tế quy định việc đấu thầu thuốc tại các cơ sở y tế công lập, các gói thầu được thực hiện theo hình thức chào hàng cạnh tranh khi có giá trị không quá 05 tỷ đồng; có kế hoạch lựa chọn nhà thầu được người có thẩm quyền phê duyệt; thuốc thuộc Danh mục thuốc thiết yếu hoặc những thuốc thông dụng, sẵn có trên thị trường với đặc tính kỹ thuật, chất lượng thuốc đã được tiêu chuẩn hóa và tương đương về chất lượng. Trường hợp mua từ nguồn ngân sách Nhà nước thì phải có dự toán mua thuốc được phê duyệt.
Đối với hình thức mua sắm trực tiếp, Thông tư quy định gói thầu được áp dụng hình thức này phải đáp ứng các điều kiện như: Nhà thầu đã trúng thầu cung cấp thuốc thông qua đấu thầu rộng rãi hoặc đấu thầu hạn chế và đã ký hợp đồng thực hiện gói thầu trước đó; Gói thầu có các thuốc tương tự và quy mô nhỏ hơn 130% so với gói thầu đã ký trước đó; Đơn giá của các thuốc thuộc gói thầu này không được vượt đơn giá của các thuốc tương ứng thuộc gói thầu đã ký hợp đồng trước đó, đồng thời phải phù hợp với giá thuốc trúng thầu được công bố tại thời điểm thương thảo hợp đồng; Thời hạn từ khi ký hợp đồng của gói thầu trước đó đến ngày phê duyệt kết quả mua sắm trực tiếp không được quá 12 tháng.
Phương thức lựa chọn nhà thầu một giai đoạn hai túi hồ sơ được áp dụng với gói thầu mua thuốc theo hình thức đấu thầu rộng rãi, đấu thầu hạn chế có giá gói thầu trên 10 tỷ đồng và gói thầu mua thuốc theo hình thức đấu thầu rộng rãi, đấu thầu hạn chế có giá gói thầu không quá 10 tỷ đồng nhưng thuốc đó cần được lựa chọn trên cơ sở kết hợp giữa chất lượng và giá.
Thông tư này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01/07/2016.